بسیاری از پمپ‌های دیافراگمی آزمایشگاهی برای کارکرد نیازی به روغن ندارند و در نتیجه از آلودگی نمونه‌ها جلوگیری می‌کنند. 

این پمپ‌ها قادر به ایجاد خلاء با کیفیت بالا هستند که برای بسیاری از کاربردهای آزمایشگاهی ضروری است. 

برخی از پمپ‌های دیافراگمی امکان تنظیم سرعت و فشار را دارند که این امکان را فراهم می‌کند تا برای کاربردهای مختلف تنظیم شوند. 

با توجه به طراحی بدون روغن و قطعات با کیفیت، این پمپ‌ها معمولاً عمر طولانی دارند و نیاز به تعمیر و نگهداری کمتری دارند. 

از پمپ‌های دیافراگمی در آزمایشگاه‌ها برای انواع مختلفی از کاربردها، از جمله فیلتراسیون، تقطیر، تبخیر، و کروماتوگرافی استفاده می‌شود. 

از هوای فشرده برای ایجاد حرکت دیافراگم استفاده می‌کند و معمولاً در محیط‌های آزمایشگاهی که نیاز به جلوگیری از جرقه یا الکتریسیته ساکن است، کاربرد دارد. 

با توجه به بودجه و نیازهای آزمایشگاه، پمپ مناسب با قیمت و گارانتی مناسب انتخاب شود.

برای ایجاد خلاء در سیستم فیلتراسیون شیشه‌ای و فیلتر کردن مایعات و نمونه‌ها. 

در فرآیندهای تقطیر و تبخیر برای کاهش فشار بخار و ایجاد شرایط مناسب. 

در دستگاه‌های کروماتوگرافی به عنوان پمپ پشتیبان یا برای ایجاد خلاء در ستون‌های کروماتوگرافی. 

برای خشک کردن نمونه‌ها، تجهیزات و سیستم‌های آزمایشگاهی با ایجاد خلاء. 

در انواع آنالیزهای آزمایشگاهی از جمله طیف‌سنجی جرمی، میکروسکوپ الکترونی و غیره.